Journal of Microbiology and Infectious Diseases

List of Papers (Total 568)

Decreasing prevalence of multi-drugs resistant Mycobacterium tuberculosis in Nashik City, India

Amaç: Hindistan’da, çok ilaca dirençli tüberküloz (ÇİD) prevalansının artışı tüberküloz sorununun kontrolünü güçleştirdi. Hindistan’ın birçok kentsel ve yarı kentsel bölgelerinde, Mycobacterium tuberculosis suşlarında çoklu ilaç direnci gösteren sürveyans verisi mevcuttur.Yöntemler: Çoklu ilaç direnci üzerine olan bu sürveyans çalışması Maharashtra, Hindistan Nashik şehri ve...

Gram negative organisms in community acquired respiratory tract infections

Amaç: Solunum yolu enfeksiyonları (SYE) hastanemizde karşılaşılan en yaygın durumlar arasındadır. Çalışmanın amacı balgam örneklerinden izole edilen çeşitli Gram negatif bakterilerin (GNB) sıklığını, antibiyotik duyarlılık paternini belirlemektir.Yöntemler: Tanımlayıcı, kesitsel çalışma Ordu Tıp Koleji Mikrobiyoloji Bölümü’nde yürütüldü. Solunum yolu enfeksiyonu şüphesi olan...

Toxoplasmosis: The value of molecular methods in diagnosis compared to conventional methods

Toksoplazmoz, zorunlu hücre içi bir protozoan parazit olan Toxoplasma gondii’nin etken olduğu bir parazit enfeksiyonudur. Dünyada en yaygın parazitlerden bir olarak kabul edilir. Parazitin bulaşması genellikle enfekte yiyecek/su tüketimi veya az pişmiş kontamine et ile elde olmaktadır. Toxoplasma gondii enfeksiyonu hamilelik döneminde geçirilirse veya bağışıklığı bastırılmış...

Small colony variant of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from an osteomyelitis case

Metisiline dirençli Staphylococcus aureus’un küçük koloni varyantları yumuşak doku enfeksiyonlarına sebep olabilmektedir. Ancak kırık ameliyatı sonrası yumuşak doku apsesi ile seyreden bir olgu henüz rapor edilmemiştir. Bu yazıda; kırık öyküsü olan 68 yaşındaki erkek hastanın sol bacağında gelişen ve tekrarlayan apseden izole edilen metisiline dirençli S. aureus küçük koloni...

Bioactive metabolite production by Streptomyces albolongus in favourable environment

Amaç: Günümüzde konvansiyonel antibiyotiklere karşı artan direnç riski nedeniyle yeni antibiyotiklere gereksinim vardır. Bu çalışmada yeni bir antimikrobiyal bileşiğin elde edilmesi denenmektedir.Yöntemler: Bir aktinomiçes türü olan Streptomyces albolongus izole edilerek optimal antimikrobiyal metabolit üretimi açısından değerlendirildi. İlk tarama seçici besiyeri ve antibiyotik...

The effects of snake venom on serum copper, zinc and magnesium levels in patients with snake bite

Amaç: Yılan ısırıkları Türkiye’nin doğu ve güneydoğu bölgelerinde sık görülen önemli bir problemdir. Bu çalışmada yılan ısırığı vakalarında serum bakır (Cu), çinko (Zn) ve magnezyum (Mg) düzeylerindeki değişiklikler araştırıldı.Yöntemler: Çalışmaya 40 yılan ısırıklı hasta ile kontrol amaçlı 80 sağlıklı gönüllü alındı. Yaklaşık 10 ml venöz kan çalışmaya alınan her bir bireyden...

In-vitro susceptibility of multiple drug resistant Pseudomonas aeruginosa to organic acids

Amaç: Pseudomonas aeruginosa fırsatçı bir patojen olup birçok antibiyotiğe ve dezenfektana doğal dirençlidir. Antimikrobiyal direnci nedeniyle bu etkenleri elimine etmek zordur. Antimikrobiyal direnci göz önüne alınarak bakterilerin çeşitli organik asitlere duyarlılığının araştırılması amaçlanmıştır.Yöntemler: Toplam yedi dirençli P. aeruginosa izolatının çeşitli organik asitlere...

Helicobacter pylori in primary gastric lymphoma and gastric cancer: A clinicopathologic and prognostic assessment

Amaç: Helicobacter pylori mide lenfoması ve adenokarsinom için risk faktörüdür. Bu çalışmada H. pylori’nin primer mide lenfoma ve mide kanserinde prognostik faktör olup olmadığı incelendi.Yöntemler: Primer mide lenfoma ve mide kanserli 255 hastanın rezeksiyon veya biyopsi materyalleri H. pylori açısından incelendi. Patoloji spesmenlerinde H. pylori varlığını değerlendirmek için...

Extended Spectrum B-lactamases and antimicrobial susceptibility among clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in the West Bank, Palestine

Amaç: D sınıfı oksasilinazlar gram negatif basiller içinde ve de özellikle P. aeruginosa kökenlerinde yaygındır. P. aeruginosa hastane enfeksiyonlarının sık nedenlerinden biridir. P. aeruginosa kökenlerinde antibiyotik direncinin ve blaOXA genlerinin kazanılması tedavi başarısını etkiler. Bu çalışmada P. aeruginosa kökenlerinde antibiyotik direnci ve blaOXA gen varlığının tedavi...

Clonal relation of nasal MRSA carrier status among hospital personnel, hospitalized patients and community

Amaç: Sağlık çalışanları, hospitalize hastalar ve sağlıklı gönüllülerde nazal metisilin-dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) kolonizasyonu ve klonal dağılımı pulsed field gel electrophoresis (PFGE) ile araştırıldı.Yöntemler: Çalışmaya 403 hastane çalışanı, 744 hasta ve 204 sağlıklı toplum bireyi alındı. Mikrobiyolojik işlemler Fırat Üniversitesi Klinik Mikrobiyoloji ve...

Thyroid disorders associated with Hepatitis C or interferon based therapies

Karaciğer dışı birçok hastalık kronik hepatit C virüs (HCV) enfeksiyonu (hematolojik hastalıklar, böbrek hastalığı, dermatolojik problemler) ile ilişkilendirilmiştir. HCV enfeksiyonunun klinik ya da subklinik oto-immün tiroid hastalıklarının artmış insidansıyla da ilişkili olduğu gösterilmiştir. Ayrıca, kronik HCV enfeksiyonunun interferon (IFN)-α ile tedavisi vakaların % 40’ına...

Hyper-immunglobulin E syndrome in a neonate: A case report

Hiper-immunglobulin E sendromu (Job Sendromu), genellikle çok yüksek IgE (> 2000 IU/ml) seviyesi, şiddetli eozinofili, soğuk stafilokok cilt absesi ve pnömoni gibi tekrarlayan enfeksiyonlar, egzama, skolyoz, eklem hiperekstansibilitesi, patolojik kırıklar, tipik bir yüz görünümü, kraniyosinostoz ve değişken bozulmuş T hücre fonksiyonu ile karakterize nadir görülen primer immün...

Genital Tuberculosis – A rare cause for vulvovaginal discharge and swelling.

Burada vulvovajinal kitle ve vajinal akıntı şikâyeti ile gelen vulvovajinal tüberküloz (TB)’lu bir hasta sunulmaktadır. Teşhis maligniteden şüphelenilerek eksize edilen biyopsi örneklerinin histopatolojik olarak incelenmesi ve servikal smear kültüründe Mycobacterium tuberculosis üremesi ile kondu. Hasta antitüberküloz ilaçlarla tedavi edildi. Bu makalede genital TB ve jinekolojik...

Standardization of process for increased production of pure and potent tetanus toxin

Amaç: Bu çalışmanın amacı nitrojen kaynağı papain digest broth içeren N. Z Case yerine modifiye Mueller Miller medium (MMMM) kullanarak tetanoz toksin üretiminin artırılabileceğini göstermektir.Yöntemler: Clostridium tetani’nin sabit pot kültürü metodu bir vibromikser ve fermentör boşluğuna steril hava sağlayan düzenek kullanılarak fermentörde kültüre edilmesi esasına dayanan...

Effect of temperature on storage of ethionamide during susceptibility testing

Amaç: Ethionamide ısıya duyarlı yapısı nedeniyle, ilaç duyarlılık testinde (DST) ısının etkisini ve sıvı veya katı ortamdaki dayanıklılık durumunun araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Ethionamide çalışma solüsyonu ve Lowenstein-Jensen (LJ) besiyeri hazırlanarak 4°C ve 37°C bekletildi ve ardından DST yöntemiyle 4 haftaya kadar MGIT 960 besiyeri ile test edildi. Bulgular...

Seroprevalence and risk factors for cytomegalovirus infection among pregnant women in southern Nigeria

Amaç: Sağırlık ve zekâ geriliğine de yol açan vertikal cytomegalovirus (CMV) enfeksiyonu dünya’da önlenebilir konjenital enfeksiyonlarının en sık sebebidir. Halen dünya’da rutin antenatal tarama konusunda bir fikir birliği yoktur. Bu çalışmanın amacı Benin Üniversitesi Hastanesi’nde hamile kadınlar arasında doğum öncesi dönemde geçirilen primer CMV enfeksiyon prevalansını ve yaş...

An investigation of type 3 secretion toxins encoding-genes of Pseudomonas aeruginosa isolates in a University Hospital in Egypt

Amaç: Pseudomonas aeruginosa tip 3 sekresyon sistemiyle (T3SS ) direk dokuya salınan 4 sekretuar toksin kullanır. Bu çalışmanın amacı hastane enfeksiyonlarından ve çevresel kaynaklardan izole edilen P. aeruginosa izolatlarında sekretuar toksin kodlayan üç genin prevalansını saptamaktır. Yöntemler: Çalışılan P. aeruginosa izolatlarının klonal yakınlığı RAPD tiplendirme metodu ile...

Helicobacter pylori genotypes among patients in a university hospital in Egypt: identifying the determinants of disease severity

Amaç: Çeşitli H. pylori genotiplerini saptamak, en yaygın olanı belirlemek ve hastalığın ciddiyetini gösteren belirteçleri saptamakYöntem: Doksan hastadan alınan biyopsiler toplandı ancak bunlardan sadece 69’u analiz edildi. H. pylori tanınması hızlı üreaz testi, histopatoloji ve polimeraz zincir reaksiyonu ile yapıldı. Bu sonuncu aynı zamanda CagA, vacAs1 ve vacAs2 gibi virülans...

High-level resistance to aminoglycoside, vancomycin, and linezolid in enterococci strains

Amaç: Bu çalışmada, enterokok suşlarının antibiyotik duyarlılık oranlarının saptanması, vankomisin duyarlı enterokok (VSE) ve vankomisin dirençli enterokok (VRE) suşlarındaki yüksek düzey aminoglikozid direncinin karşılaştırılması amaçlandı. Yöntemler: Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi kliniklerinden gönderilen örneklerden, laboratuvarımızda izole edilen 100 adet...

In-vitro susceptibility of linezolid against methicillin resistant Staphylococcus aureus at a tertiary care hospital in Pakistan

Amaç: Metisilin dirençli Staphylococcus aureus belirgin morbidite ve mortaliteye neden olan önemli bir nozokomiyal patojendir. Bu çalışmanın amacı, metisilin dirençli S. aureus’a karşı linezolidin in vitro etkinliğini değerlendirmektir.Yöntemler: Army Medical College Rawalpindi Mikrobiyoloji Anabilim Dalında, Temmuz-Ocak 2010’da yürütülen tanımlayıcı bir çalışmadır. Linezolid...

Chronic osteomyelitis of skull associated with necrotic injury after trauma: A case report

Otuziki yaşında erkek hasta acil servise sağ temporoparietal alanda 4x11 cm doku defekti ile getirildi. Beyin tomografisinde sağ parietal alanda doku defekti görüldü fakat kemik doku bütünlüğü korunmaktaydı. Kraniyal kemiklerin korunması amacıyla serbest flep operasyonu yapıldı. Hastaneden taburcu olduktan 2 ay sonra nekrotik görünümde kirli akıntılı yara ile başvurdu...

Cutaneous anthrax cases leading compartment syndrome

Bacillus anthracis şarbon hastalığının etkenidir. Şarbon, üç klinik formu bulunan, zoonozdur. Klinik formlar deri, inhalasyon ve gastrointestinal şarbondur. Olguların % 95’ini deri şarbonudur. Hastalık genellikle kendi kendine sınırlanır. Şarbonunun klinik seyri bazı olgularda ağır ve komplike olabilir. Menenjit, septik şok ve kompartman sendromu gibi komplikasyonlar görülebilir...

Frequency of active HCV infection among anti-HCV positive patients in selected districts of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan

Amaç: Bu çalışmanın amacı, Khyber Pakhtunkhwa eyaletinde (KPK) antiviral tedavi seçeneklerini değerlendirmek amacıyla, anti-HCV pozitif olan kişiler arasında aktif HCV enfeksiyonu sıklığını belirlemektirYöntemler: Kan örnekleri (3075 adet) KPK’nın seçilmiş bölgelerindeki hastalardan toplandı ve Peşaver Üniversitesi Biyoteknoloji ve Mikrobiyoloji Merkezi Teşhis Laboratuvarına...

Investigation of the Prevalence of vanA and vanB genes in vancomycin resistant enterococcus (VRE) by Taq Man real time PCR Assay

Amaç: Enterokoklar önemli hastane enfeksiyonu etkenidirler ve antimikrobiyal direnç potansiyelleri nedeniyle rezistans genlerinin yayılmasında önemli rolleri bulunmaktadır. Günümüzde bu mikroorganizmalar önemli bir halk sağlığı sorunu olarak tanımlanmıştır. Bu çalışmada İran’daki bazı hastanelerde değişik klinik örneklerden izole edilen vankomisin dirençli enterokok (VRE)’lar...